Abreviaturas utilizadas en las notas y la bibliografía
AA: Archivo de la Casa de los Duques de Alba, Biblioteca de Liria, Madrid, con caja y folio
ACA: Arxiu de la Corona d’Aragó, Barcelona
CA: Consell d’Aragó
ACP: Archivo de los Condes de Puñonrostro, Carmona (Sevilla)
Bobadilla Papeles de don Francisco de Bobadilla
ADM: Archivo de los Duques de Medinaceli, Hospital Tavera (Toledo)
AH: Archivo Histórico
AGI: Archivo General de Indias, Sevilla
IG: Indiferente General
AGNM: Archivo General de la Nación, México
CRD: Cédulas reales duplicadas
AGP: Archivo General de Palacio, Sección Administrativa, Palacio Real de Madrid
CR: Cédulas reales
AGRB: Archives Générales du Royaume/Algemeen Rijksarchief, Bruselas
Audience: Papiers d’État et d’Audience
MD: Manuscrits Divers
SEG: Secrétairie d’État de Guerre
AGS: Archivo General de Simancas
CC: Cámara de Castilla
CJH: Consejos y Juntas de Hacienda
CMC: Contaduría Mayor de Cuentas (con época y legajo)
CS: Contaduría del Sueldo (con época y legajo)
CSR: Casas y Sitios Reales
DGT: Dirección General del Tesoro
Estado: Negociación de Estado
GA: Guerra Antigua
PR: Patronato Real
SP: Secretarías Provinciales
AHN: Archivo Histórico Nacional, Madrid
Consejos: Consejos Suprimidos
Inq: Inquisición (con legajo o libro y folio)
OM: Órdenes Militares
AHR: American Historical Review
Álava: Don Francés de Álava y Beamonte. Correspondencia inédita de Felipe II con su embajador en París (1564-1570), eds. P. y J. Rodríguez (San Sebastián, 1991)
AM: Archivo Municipal (y la ciudad correspondiente)
AMAE (M): Archivo del Ministerio de Asuntos Exteriores y Cooperación, Madrid
AEESS: Archivo de la Embajada Española cerca la Santa Sede
AMAE (P): Archive du Ministère des Affaires Etrangères, París
MDFDE: Mémoires et documents: Fonds divers, Espagne
ANTT: Arquivo Nacional da Torre do Tombo, Lisboa
TSO: CG: Tribunal do Santo Oficio: Conselho Geral
APO: Archivo Portuguez-Oriental, ed. J. H. de Cunha Rivara, 6 vols. (Nova Goa, 1857-1876)
ARA: Algemene Rijksarchief, La Haya
ARSI: Archivum Romanum Societatis Iesu, Roma
ASF: Archivio di Stato, Florencia
DU: Ducato di Urbino, Clase I
MP: Mediceo del Principato
ASG: Archivio di Stato, Génova,
AS: Archivio Segreto
ASL: Archivio di Stato, Lucca, Archivio diplomatico
ASMa: Archivio di Stato, Mantua
AG: Archivio Gonzaga
ASMo: Archivio di Stato, Módena,
CD AS: Cancellaria ducale, sezione estero, Ambasciatore Spagna
ASN Archivio di Stato, Nápoles, Sezione diplomatico-politico
CF: Carte Farnesiane
ASP: Archivio di Stato, Parma
CF: Carteggio Farnesiano
AST: Archivio di Stato, Turín
LM: Lettere Ministri
ASV: Archivio Segreto Vaticano, Roma
LP: Lettere principi
NS: Nunziatura Spagna
ASVe: Archivio di Stato, Venecia
SDS: Senato Dispacci Spagna
BAV: Biblioteca Apostólica Vaticana, Roma
UL: Urbinates Latini
BCR: Biblioteca Casanatense, Roma
BCRH: Bulletin de la Commission royale d’Histoire
BL: British Library, Departamento de Manuscritos, Londres
Add.: Additional Manuscripts
Cott.: Cotton Manuscripts
Eg.: Egerton Manuscripts
Harl.: Harleian Manuscripts
Lans.: Lansdowne Manuscripts
BMB: Bibliothèque Municipale, Besançon
Ms Granvelle: Cabinet des Manuscrits, Collection de Granvelle
BNE Ms.: Biblioteca Nacional de España, Sección de Manuscritos, Madrid
BMO: La batalla del Mar Océano, ed. J. Calvar Gross, J. I. González-Aller Hierro, M. de Dueñas Fontán y M. del C. Mérida Valverde, 3 vols. (Madrid, 1988-1993)
BNP: Bibliothèque Nationale de France, París, Sección de Manuscritos
f. f.: Fonds français
Ms. Esp.: Manuscrit espagnol
Bod: Bodleian Library, Sección de Manuscritos Occidentales, Oxford
Bouza, Cartas: Cartas de Felipe II a sus hijas, ed. F. J. Bouza Álvarez (Madrid, 1998)
BPU: Bibliothèque Publique et Universitaire, Ginebra
Favre: Collection Manuscrite Édouard Favre
BRAH: Boletín de la Real Academia de la Historia
BRB Ms: Bibliothèque Royale/Koninklijke Bibliotheek, Sección de Manuscritos, Bruselas
BSLE Ms: Biblioteca del Real Monasterio de San Lorenzo de El Escorial, Manuscritos
BZ: Biblioteca Zabálburu, Colección Altamira, Manuscritos (con carpeta y folio), Madrid
CCG: Correspondance du Cardinal de Granvelle 1565-1586, ed. E. Poullet y C. Piot, 12 vols. (Bruselas, 1877-1896)
CDCV: Corpus Documental Carlos V, ed. M. Fernández Álvarez, 5 vols. (Salamanca, 1974-1981)
CMPG: Correspondance de Marguerite d’Autriche, duchesse de Parme, avec Philippe II, ed. L. P. Gachard, 3 vols. (Bruselas, 1867-1881)
CMPT: Correspondance française de Marguerite d’Autriche avec Philippe II, ed. J. S. Theissen y H. A. Enno van Gelder, 3 vols. (Utrecht, 1925-1942)
CODOIN: Colección de documentos inéditos para la historia de España, 112 vols. (Madrid, 1842-1895)
CODOIN América: Colección de documentos inéditos relativos al descubrimiento, conquista y organización de las antiguas posesiones españoles en América y Oceanía (42 vols., Madrid, 1864-1884)
CSPF: Calendar of State Papers Foreign: Elizabeth, 23 vols., eds. J. Stevenson y otros (Londres, 1863-1950)
CSPR: Calendar of State Papers relating to English affairs preserved principally at Rome, 2 vols., ed. J. M. Rigg (Londres, 1916-1926)
CSPSp: Calendar of State Papers: Spanish, 19 vols., eds. J. A. Bergenroth y otros (Londres, 1862-1954) y Calendar of Letters and State Papers relating to English affairs preserved in, or originally belonging to, the archives of Simancas: Elizabeth, 4 vols., ed, M. A. S. Hume, (Londres, 1892-1899)
CSPV: Calendar of State papers and manuscripts relating to English Affairs existing in the archives and collections of Venice, eds. H. F. Brown y otros, 38 vols. (Londres, 1864-1947)
CUL: Cambridge University Library, Colección de Manuscritos, Cambridge
DHME: Documentos para la historia del monasterio de San Lorenzo El Real de El Escorial, eds. J. Zarco Cuevas, G. de Andrés y otros, 8 vols. (Madrid, 1917-1962)
Donà: La corrispondenza da Madrid dell’ ambasciatore Leonardo Donà (1570-1573), eds. M. Brunetti y E. Vitale, 2 vols. (Venecia-Roma, 1963)
Douais: Dépêches de M. de Fourquevaux, ambassadeur du roi Charles IX en Espagne, 1565-1572, ed. Douais, C., 3 vols. (París, 1896-1904)
EHR: English Historical Review
Encinas: Cedulario Indiano recopilado por Diego de Encinas (1596: ed. A. García Gallo, 4 vols., Madrid, 1945-1946)
GCP: Correspondance de Philippe II sur les affaires des Pays-Bas, ed. L. P. Gachard, 5 vols., (Bruselas 1848-1879)
GCT: Correspondance de Guillaume le Taciturne, ed. L. P. Gachard, 6 vols. (Bruselas, 1849-1857)
GPGP: A. González Palencia, Gonzalo Pérez, secretario de Felipe II, 2 vols. (Madrid, 1946)
GRM: Retraite et mort de Charles-Quint au monastère de Yuste. Lettres inédites, ed. L. P. Gachard, 3 vols. (Bruselas, 1854-1856)
Gachard, Voyages Collection des voyages des souverains des Pays-Bas